درخت فیلوژنی بیان روابط تکاملی میان گروهی از خصوصیات همولوگ است. بر اساس نظریه Fitch همولوژی رابطه دو خصوصیت به ارث رسیده و معمولا همگرا است و این خصوصیت در جد آن ها وجود داشته است.  صفت می تواند هر چیزی باشد، توالی DNA، توالی پروتئین، صفات ظاهری یا ویژگی های رفتاری.